Modo Duelo
Hasta cuatro jugadores recorren un laberinto y recogen fortianitas mientras los espectros vigilan los pasillos. Una ronda dura tres minutos. Una fortianita pequeña vale un punto, una mediana dos, y una grande tres. Un golpe de espectro quita la mitad de las fortianitas, y quien cae por una trampilla deja atrás buena parte de las suyas.
4 jugadores máx. Se puede jugar sin la tarjeta DS.
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 301, 302, 303
Escenarios
La elección de escenario muestra doce botones con seis aspectos. Los seis primeros son para cualquier número de jugadores, los tres siguientes para dos jugadores, y los tres últimos para expertos. El juego no da nombre a los escenarios; los nombres de aquí son los de la guía.

Tierra antiguaPerfecto para novatos.
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 304

Llanuras heladasSuelo deslizante.
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 305

Arena de fuego¡Cuidado con la lava!
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 306

Llanuras glacialesSuperficie deslizante. Para jugadores avanzados.
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 307

Campo de batalla abrasado¡Cuidado con la lava! Para jugadores avanzados.
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 308

Escenario de sombras¡Ojo! Enemigos ocultos. Para jugadores avanzados.
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 309

Tierra antigua (dos jugadores)¡Lucha entre dos! Nivel principiante.
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 304

Llanuras heladas (dos jugadores)¡Lucha entre dos! Suelo deslizante.
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 305

Arena de fuego (dos jugadores)¡Lucha entre dos! Ojo con la lava...
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 306

Llanuras glaciales (expertos)Suelo deslizante. Nivel avanzado.
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 307

Campo de batalla abrasado (expertos)¡Cuidado con la lava! Nivel avanzado.
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 308

Escenario de sombras (expertos)¡Ojo! Enemigos ocultos. Para jugadores avanzados.
The Legend of Zelda: Spirit Tracks, Prima Official Game Guide, pág. 309
Reglas
¡Lucha y consigue más fortianitas que el resto!
¡Reúne las fortianitas!
¡… segundos para el rayo! ¡Acércate a algún rival!
¡… segundos para el rayo! ¡Huye de él!
¡Han aparecido agujeros! ¡Cuidado por dónde pisas!
¡Ahora eres invencible! ¡Aprovecha la oportunidad!
¡Hay alguien invencible! ¡Procura que no te toque!